Enheten för Zoologi ansvarar för museets röntgenutrustning och TEM-laboratorium
Med hjälp av röntgen kan man bland annat studera skelettstrukturer hos djur. Exempel på andra tillämpningsområden är att hitta ammunitionsrester i djur som faller inom ramen för Statens vilt.
Med TEM (Transmission Electron Microscopy) kan man undersöka ultratunna snitt av djur och växter ner på vävnadsnivå. Enheten för Zoologi driver museets TEM-lab för snittning och preparering av materialet. Mikroskopen finns på Stockholms Universitet.