David Bernvi

Kvalitetssäkrar data i Miljöprovbanken

David Bernvi är förste assistent med ansvar för import och export av data som hör till Miljöprovbanken. Han arbetar också mycket med historisk data som sträcker sig tillbaka på ett tidsspann över halvt sekel. Dessutom arbetar David med biologiska samlingar i Miljöprovbanken och han hanterar biologiska vävnadsprover för forskningsändamål.

Vad ingår i din tjänst?

- Jag arbetar med Miljöprovbanken som finansieras av Naturvårdsverket, och som är en av världens äldsta miljöprovbanker. Primärt svarar jag för registrering i databasen av det material som kommer in. Mitt fokus ligger på arbetet kring databasen ESBase på Miljöprovbanken. Jag tar fram data för forskningsändamål. För närvarande består arbetet främst av datatvätt, dataläggning och kvalitetssäkring av data samt sammanställning av data. Just nu sker ett utvecklingsarbete av ESBase. Vi har tagit fram en ny importfunktion som kan importera äldre Excel-databaser. Vi kan nu uppdatera ESBase 10–100 gånger snabbare än historiskt med hjälp av ett Python-program.

Miljöprovbanken innehåller biologiskt material från mitten av 1960-talet. Samlingen består till stor del av frysta vävnadsprover från svenska däggdjur, fåglar, fiskar, musslor och humanmjölk. Dessa prover lagras antingen i frysrum (-25°C) eller i lågtemperaturfrysar (-80°C).

Davids arbetsgrupp förvaltar även torrsamlingar med material som förvaras i rumstemperatur. Torrsamlingarna består av olika typer av material där bland annat otoliter, operkulum och fjäll från fiskar, skelettmaterial, äggskal, fjädrar, musselskal, däggdjurständer och flera typer av histologiska prover. De flesta av dessa kan kopplas samman med accessioner vars mjukvävnadsprover finns sparade i frysarna.

Utöver det finns även mossa, sediment, slam från reningsverk, sädesslag och fröer sparade.

Systematisk insamling till Miljöprovbanken

Material samlas in till Miljöprovbanken genom systematisk insamling kopplat till olika nationella miljöövervakningsprogram, samt genom opportunistisk insamling av avlidna djur som går under Statens vilt. Idag innehåller Miljöprovbanken prover från över 400 000 accessioner och har en årlig tillväxt med prover från ungefär 10 000 individer.

Varje år bidrar Miljöprovbanken med ovärderliga prover inom olika forskningsprojekt kopplade till nutida och historiska frågeställningar om Sveriges miljötillstånd och har under åren haft stor betydelse för vår kunskap kring miljögifter i Sverige. Över tid har samlingen även visat sig få en bredare användning och prover har ingått i såväl genetiska studier, dietstudier, förekomst av mikroplaster, studier av stabila isotoper för att studera förändringar i näringsvävar över tid, för att nämna några exempel.