Samantha López Clinton

Vad är din uppgift på museet?
Jag är doktorand vid institutionen för bioinformatik och genetik vid NRM, i gruppen som leds av Tom van der Valk. Jag är också knuten till Centrum för paleogenetik, och till Zoologiska institutionen vid Stockholms universitet. Min anställning som doktorand är totalt 4 år lång, under vilken jag ska genomföra fyra forskningskapitel, eller manuskript, samt skaffa poäng genom en rad kurser, seminarier och läsningar.

Vad handlar din forskning om?
I min forskning utforskar jag möjligheterna med populationsgenomik i metagenomisk skala. Med andra ord använder jag datorprogram för att distrahera DNA-data från blandade prover för vilka det exakta artinnehållet är okänt. Det kan till exempel vara en burk med flera leddjur samlade i naturen, ett vattenprov från havet eller till och med ett sedimentprov från botten av en sjö. Det är mitt jobb att använda bioinformatik (datorprogram som tillämpas på biologiska problem) för att identifiera de arter som finns i provet och placera dem i sammanhanget med befintliga populationer. Jag ställer frågor som: är insekterna i norra Sverige genetiskt skilda från de i söder? Varför kan detta vara?

För tillfället, 2024, arbetar jag med ett samarbetsprojekt med projektet Insect Biome Atlas (IBA). Vi jämför metagenomiska och metabarcoding-metoder på blandade insektsprover som samlats in över hela Sverige av IBA, ett av de största medborgarvetenskapliga initiativen i Skandinavien. Metagenomics hänvisar till användningen av all genomisk data i ett prov (ett genom är hela DNA-informationen i en organism), medan metabarcoding endast använder en bråkdel (eller en streckkod) av genomet som kan indikera vilken art informationen kom från.

Om du skulle beskriva dig själv med tre ord, vilka skulle det vara?
Interkulturell, kreativ, nyfiken!

Hur kommer det sig att du blev forskare? Har du några förebilder?
Jag har alltid beundrat Jane Goodall – känd för sitt arbete med att studera vilda schimpanser. Jag blev också väldigt inspirerad av Dr. Mrinalini Watsa, en fantastisk forskare som gör så mycket för forskning, men också för bevarande, vetenskapens inkludering och social rättvisa.

Vad är det mest intressanta med ditt jobb?
Det mest intressanta med mitt jobb är att kunna bidra till verkliga problem som bevarande och att ligga i framkant av beräkningsmetoder som tillämpas på studier av biologisk mångfald. Jag har också många speciella möjligheter som doktorand, som att delta i och presentera på internationella konferenser, och att ta kurser i undervisning, naturvetenskaplig design och nya tekniker.

Hur kom du till Naturhistoriska riksmuseet?
Jag erbjöds en doktorandtjänst av Tom van der Valk, en Data Driven Life Science Fellow 2022. Jag drogs direkt till projektet och gruppen, och jag visste att det var där jag ville utveckla mina forskarkunskaper.

Berätta om ett projekt eller en arbetsuppgift som du gärna minns
Som doctorand vid Zoologiska institutionen vid Stockholms universitet kunde jag tillbringa 10 dagar på den Svenska tundran med Svenska Fjällrävsprojektet. Där vandrade och campade jag tillsammans med en annan doktorand som är en god vän, runt avlägsna områden i Jämtland och hjälpte till att samla in data för en landsomfattande övervakning av den hotade fjällräven. Det var ett hårt fältarbete, men värt det. Vi såg otaliga hisnande landskap, blev omkörda av hundratals renhjordar och – naturligtvis – såg vi vilda fjällrävar!

Vad vill du uppnå med din forskning? Själv eller tillsammans med andra.
Jag strävar efter att hjälpa till att göra bevarandegenomik mer tillgänglig, särskilt för underfinansierade regioner eller demografi, genom att göra betydande framsteg inom området för bioinformatiska genomiska analyser.

Vad gör du på din fritid?
Jag tycker om att vandra, plocka svamp, dansa och lära mig språk. Jag brinner också mycket för uppsökande verksamhet, jag har hållit flera föredrag och vetenskapliga workshops på skolor, universitet och kulturhus. Jag är för närvarande medordförande i arbetsgruppen för inkludering, mångfald, jämlikhet och tillgång (IDEA) för Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE).