Hitta hit:
T-bana: Universitetet
Frescativägen 40

Ordinarie öppettider:
Tisdag-söndag 10-18


  • Huvudmeny

Förhistoriskt DNA

The aDNA laboratory Photo: Staffan Waerndt NRM

aDNA-laboratoriet Foto: Staffan Waerndt (NRM)

Sammanfattning

Förhistoriska prover, såsom ben, tänder och sedimentlager, innerhåller minutiösa mängder förhistoriskt DNA. Den typen av DNA ger oss möjligheten att se tillbaka i det förflutna, och kan utnyttjas för att spåra evolutionära förändringar i realtid. Vi använder oss av en kombination av helgenom-sekvensering och riktad, specifik sekvensering för att utforska evolutionär historia hos flera utdöda och nu levande arter. De laborativa analyserna utförs i ett sterilt laboratorium som endast är ämnat för arbete med förhistoriskt DNA, detta för att minimera effekterna av eventuell kontanimering.

De huvudsakliga målen med vår forskning är att (i) uppskatta effekter av historiska klimatförändringar på arters evolution och demografi, (ii) utforska historiska genflöden mellan arter och populationer, samt (iii) utvärdera de genetiska processer som äger rum när arter närmar sig utrotning. Exempel på aktuella projekt inkluderar helgenom-sekvensering av ett flertal ullhåriga mammutar för att mäta inavel och förlust av genetisk variation i den sista överlevande populationen på Wrangels ö, kartläggning av de genetiska skillnaderna mellan varg och hund samt utforskning av släktskapet mellan utdöda och nulevande noshörningsarter.

Specifika frågor som vi adresserar inkluderar:

  • Hur påverkades arktiska arter av den globala temperaturökningen som ägde rum i slutet av den senaste istiden?
  • Påverkades utdöda arter av genetiska faktorer innan de dog ut?
  • Hur kan vi använda paleogenomiska data för att bättre uppskatta divergenstider mellan olika taxa?

Projektdeltagare vid NRM

Love Dalén (Forskningsledare)

David Díez-del-Molino (Postdoktor)

Nicolas Dussex (Postdoktor)

Patrícia Pečnerová (Doktorand)

Tatiana Feuerborn (Doktorand)

Utvalda publikationer

Pecnerova P, Díez-del-Molino D, Vartanyan S, Dalén L. 2016. Changes in variation at the MHC class II DQA locus during the final demise of the woolly mammoth. Scientific Reports, 6: 25274.

Lagerholm VK, Sandoval-Castellanos E, Vaniscotte A, Potapova O, Tomek T, Bochenski ZM, Shepherd P, Barton N, Van Dyck MC, Miller R, Höglund J, Yoccoz NG, Dalén L, Stewart JR. 2016. Range shifts or extinction? Ancient DNA and distribution modelling reveal past and future responses to climate warming in cold-adapted birds. Global Change Biology, 23: 1365-2486.

Palkopoulou E, Mallick S, Skoglund P, Enk J, Rohland N, Li H, Omrak A, Vartanyan S, Poinar H, Götherström A, Reich D, Dalén L. 2015. Complete genomes reveal signatures of demographic and genetic declines in the woolly mammoth. Current Biology, 25, 1395–1400.

Skoglund P, Ersmark E, Palkopoulou E, Dalén L. 2015. Ancient wolf genome reveals an early divergence of domestic dog ancestors and admixture into high-latitude breeds. Current Biology, 25: 1515–1519.